Gananoque bildet das nördliche Tor zum Archipel der Thousand Islands, wo 1.864 Inseln den St. Lawrence River zwischen dem Lake Ontario und dem atlantischen Abfluss durchziehen. Die Zählung geht auf die Grenzvermessung der International Joint Commission von 1909 zurück, die eine Insel als jede Landmasse definierte, die größer als ein Quadratfuß ist und das ganze Jahr über zwei lebende Bäume trägt. Das Granitgestein hier stammt aus dem Präkambrischen Schild, wurde durch den Gletscherrückzug vor 12.000 Jahren freigelegt und zu den abgerundeten Untiefen verwittert, die moderne Seekarten prägen. George Boldt gab 1900 seine vom Rhein inspirierte Burg auf Heart Island in Auftrag und ließ italienische Steinmetze und schottische Gärtner eine 120-Zimmer-Sommerresidenz für seine Frau Louise errichten. Der Bau wurde 1904 nach ihrem Tod abrupt eingestellt; das Anwesen blieb verlassen, bis die Thousand Islands Bridge Authority 1977 die Verwaltung übernahm. Heute empfängt das Schloss jährlich 125.000 Besucher und ist nur über das Wasser erreichbar. Die strategische Lage des Archipels machte es während des Krieges von 1812 zu einer umkämpften Zone – Befestigungsanlagen auf Chimney Island und Grenadier Island sind von passierenden Schiffen aus noch sichtbar. Obwohl Suchen nach „1000 Islands Dinner Cruise Gananoque“ auf die Uferpromenade der Stadt abzielen, finden derzeit keine abendlichen Dinner-Kreuzfahrten von den Docks in der Main Street 280 statt. Kingston, 30 Kilometer westlich, bietet Abfahrten für Sonnenuntergangs- und Mittagsfahrten auf dreistöckigen Schaufelraddampfern und verglasten Speiseschiffen an. Die eigene Flotte von Gananoque konzentriert sich auf tagsüber stattfindende Sightseeing-Routen: Die 90-minütige Boldt-Castle-Route führt durch die American Narrows und passiert die Fußgängerbrücke von Zavikon Island – oft fälschlicherweise als die kürzeste internationale Brücke der Welt bezeichnet, obwohl beide Ufer in Kanada liegen. Ivy Lea, 12 Kilometer östlich, dient als sekundärer Einstiegspunkt für landschaftlich reizvolle Kreuzfahrten unter der Thousand Islands International Bridge. Die Fertigstellung des St. Lawrence Seaway im Jahr 1959 hob den Wasserspiegel um zwei Meter an und überflutete historische Docks und Uferstrukturen. Moderne Kreuzfahrtbetreiber navigieren durch markierte Kanäle, um untergetauchte Untiefen zu vermeiden; die Tiefe variiert im zentralen Korridor des Archipels zwischen drei und 75 Metern. Die Navigationssaison läuft von Mai bis Oktober, wenn die Wassertemperaturen einen sicheren Betrieb und eine eisfreie Passage durch die Stützpfeiler der internationalen Brücke ermöglichen.